利用密度梯度超速離心法從水稻幼苗中分離和富
獲得高質量的高爾基體(ti) 分離物,對於(yu) 進一步分析和理解這種細胞器至關(guan) 重要。Himac 目前隸屬於(yu) Eppendorf集團,擁有 60 多年定製研發落地式超速離心機的豐(feng) 富經驗。在本應用說明中,我們(men) 將采用一係列差速離心和非連續蔗糖密度梯度離心操作,使用 Himac CP80-NX離心機(搭配 P32ST 和 P40ST 水平轉子)從(cong) 水稻幼苗中分離高爾基體(ti) 。
圖 1:搭載 P32ST 和 P40ST 型水平轉子的 CP 係列超速離心機
120 多年前,卡米洛 · 高爾基(Camillo Golgi)首次發現了真核細胞的高爾基體(ti) 。之後,(電子)顯微技術的發展揭示了高爾基體(ti) 的複雜結構,而進一步的生化分析則闡明了細胞內(nei) 這種細胞器的各項功能 [2]。在高等生物細胞中,作為(wei) 分泌途徑的一部分,高爾基體(ti) 負責合成複合多糖體(ti) 、加工蛋白質並將蛋白質分配到其他細胞器中(圖 2)[1]。
葉綠體(ti) 蛋白質的轉運機製
(1) 通過TOC-TIC複合體(ti) 的正常轉運途徑
(2) 通過分泌途徑的特殊轉運途徑(ER-高爾基體(ti) )
圖 2:植物細胞通過以下途徑完成蛋白質轉運:
(1)Toc-Tic複合體(ti) 轉運機製(2)高爾基體(ti) 和分泌途徑
α- 澱粉酶就屬於(yu) 此類蛋白質,它是一種負責植物內(nei) 澱粉分子水解的糖苷酶。研究表明,α- 澱粉酶在內(nei) 質網(ER)核糖體(ti) 處合成並在內(nei) 質網內(nei) 腔中糖基化後被輸送到高爾基體(ti) 進行低聚糖改性 [3]。然而,由於(yu) 高爾基體(ti) 與(yu) 內(nei) 質網(ER)等其他膜係統形成了複雜結構 [2],因此分離這種細胞器的不同部分尤其困難。事實上,高爾基體(ti) 膜的某些部位還經常會(hui) 被液泡等其他相連的膜係統汙染 [2]。因此,在本應用說明中,我們(men) 將使用一係列差速離心和密度梯度離心操作(富集特定膜係統的最成熟技術之一)[2],從(cong) 水稻幼苗中獲取高爾基體(ti) 膜。用這種技術可以獲取高純度、高質量提取物並用於(yu) 質譜等進一步的下遊分析。下麵我們(men) 將詳細介紹使用 CP80-NX 超速落地式離心機(搭配 P32ST 和P40ST 轉子)分離獲取高質量高爾基體(ti) 的過程。
材料與(yu) 方法
所用材料
CP80NX 超速離心機搭配以下水平轉子:
1. P32ST 型水平轉子,適用於(yu) 40 mL PET 離心管
2. P40ST 型水平轉子,適用於(yu) 13 mL PET 離心管
第 1 步:
使用 P32ST 型水平轉子 (40 mL PET 離心管) 和 P40ST 型水平轉子 (13 mL PET 離心管),完成微粒體(ti) 純化過程。
1. 在 4°C 條件下,使用水平轉子,在 40 mL PET 離心管中以15,000 x g 的速度離心純化水稻提取物 30 分鍾,並移除沉降物。
2. 在 13 mL PET 離心管中,底部鋪墊 1 mL 50% 濃度蔗糖溶液,中間層裝入 1 mL 15% 蔗糖溶液,頂部裝入 11 mL 上清液。15% 蔗糖溶液置於(yu) 1 mL 50% 蔗糖墊層之上,將11 mL 上清液裝入 1 mL 15% 蔗糖溶液頂部。
3. 在 4°C 條件下,以 100,000 × g 的離心力離心 3 小時,然後收集 50% 蔗糖墊層溶液中截留的微粒體(ti) 部分。
第 2 步:
使用 P40ST型水平轉子 (13 mL PET離心管),從(cong) 微粒體(ti) 部分純化高爾基體(ti) 。
1. 使用手持糖量儀(yi) ,利用 60% 蔗糖緩衝(chong) 液將收集的微粒體(ti) 蔗糖溶液密度中和至 42%。在該溶液上層裝入 1-2 mL 其他非連續蔗糖密度梯度,每個(ge) 梯度由 1 mL 濃度為(wei) 26%、30%、34% 和 38% 的蔗糖層組成。隨後,小心地加滿水至13 mL。
2. 4°C,100,000 × g 離心 3 小時,然後迅速收集漂浮在34% 和 38% 蔗糖層之間界麵相的高爾基體(ti) 部分(1)。
3. 再次將收集的高爾基體(ti) 部分中和至蔗糖密度 42%,然後再次裝入 1-2 mL 不連續的蔗糖梯度溶液,每個(ge) 梯度由 1 mL 26%、30%、34% 和 38% 的蔗糖層組成。小心加滿水至13 mL。
4 .4°C, 100,000 × g 離心 3 小時,然後收集漂浮在 34% 和38% 蔗糖層之間界麵相的高爾基體(ti) 部分(2)。
通過使用細長的 13 mL 離心管完成兩(liang) 次浮選離心,即可從(cong) 微粒體(ti) 中分離出高純度的高爾基體(ti) 。回收後的高爾基體(ti) 部分(2)可用於(yu) 實驗和印跡分析。所有蔗糖濃度單位均為(wei) 質量百分比(w/w)。
結果與(yu) 討論
非連續密度梯度離心法是分離或富集亞(ya) 細胞成分的標準方法。在大多數情況下,我們(men) 利用沉降係數或特定密度的差異來獲得分離物。在細胞器的分離應用中,決(jue) 定這些分離參數的主要因素是相應膜的組成成分。獲得高純度的分離物通常比較困難,這一點在與(yu) 其他膜係統緊密相連的高爾基體(ti) [2] 上尤為(wei) 明顯。
因此,高純度的高爾基體(ti) 膜對於(yu) 分析和研究高爾基體(ti) 蛋白質組 [1] 或細胞器內(nei) 特定的蛋白質至關(guan) 重要。
本文使用了兩(liang) 種不同型號的水平轉子,配合一係列非連續蔗糖密度梯度離心步驟,高效可靠地獲得了高質量的高爾基體(ti) 分離物。
在棄掉第一道離心步驟中的細胞碎片後,將上清液裝入第一個(ge) 非連續的蔗糖梯度上(見圖 3)。在 15% 和 50% 的蔗糖相之間為(wei) 富集的微粒體(ti) 部分。隨後,微粒體(ti) 部分通過兩(liang) 次非連續的蔗糖梯度浮選分離步驟而進一步被純化,其中高爾基體(ti) 沉積在梯度為(wei) 34% 和 38% 的蔗糖相之間(圖 3)。Asakura 等人 [4] 的研究表明,經過第二次浮選分離操作後,高爾基體(ti) 部分的純度顯著提高。可以采用免疫印跡法對以下標記酶進行檢測,進而對高爾基體(ti) 的質量進行分析:例如 UGPase(尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶:細胞質基質)、RbcL(二磷酸核酮糖羧化酶 長鏈:質體(ti) )、COXII(細胞色素 C 氧化酶亞(ya) 基 2:線粒體(ti) )和 ARF(腺苷核糖基化因子:高爾基體(ti) )。
結論
水平轉子 P32ST 和 P40ST 是分離高爾基體(ti) 的理想選擇,兩(liang) 者搭配可以實現從(cong) 40 mL 大容量離心管到 13 mL 小容量離心管的流暢切換,同時保證了優(you) 秀的離心效果。Himac 13 mL PET離心管采用了特殊的細長造型,可實現更長的浮選距離,從(cong) 而提升了高爾基體(ti) 部分的純度。此外,轉子采用的頂部裝載設計,便於(yu) 完成蔗糖梯度處理的精細操作,並且可以將意外混合汙染的風險降至最低。